坐在坟头训鬼

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关于

我本人于2018年开始从事生物信息数据分析的工作,其实主要是做NGS数据分析,来辅助实验室内部成员完成各项课题。期间接触最多的是单细胞测序数据,并搭建了一个供实验室人员在局域网内使用的单细胞数据库,方便大家查阅实验室内部的和文献里的单细胞数据。此外,也搭建了一些其他测序数据类型的分析流程,比如CuntTag、BulkRNAseq、DamIDseq、WGBS、16S、WGS等数据类型。在学习测序数据分析的同时,也逐渐熟练了R语言编程,掌握了基本的Linux操作命令,和初步的Python语言编程。至今已工作多年,目前对自己的评价是“资深小白”。

作为实验室内唯一的数据分析技术员,生信技术的交流机会还是挺少的,主要是依靠各大在线交流平台。在分析实践中,面对众多的可选软件和参数,很多情况下的选择,都是基于一种信念吧!这种信念一般是基于软件的流行度,更新频率等等。

工作经历

  • 2018.10-至今 就职于北京生命科学研究所袭荣文实验室,岗位是数据分析技术员。

  • 2016.1-2018.10 就职于某生物信息科技公司,主要从事生物信息分析软件的销售及技术培训工作。

教育经历

  • 2013.9-2016.1 就读于中国农业大学生物学院,专业为生物化学于分子生物学。

  • 2009.9-2013.6 就读于河北大学生命科学学院,专业为生物技术。

参与文章

  • Guo X, Wang C, Zhang Y, et al. Cell-fate conversion of intestinal cells in adult Drosophila midgut by depleting a single transcription factor[J]. Nature Communications, 2024, 15(1): 2656.

  • Guo, X., Zhang, Y., Huang, H., & Xi, R. (2022). A hierarchical transcription factor cascade regulates enteroendocrine cell diversity and plasticity in Drosophila. Nature Communications, 13(1), 6525.

  • Shi, J., Jin, Z., Yu, Y., Zhang, Y., Yang, F., Huang, H., … & Xi, R. (2021). A progressive somatic cell niche regulates germline cyst differentiation in the Drosophila ovary. Current Biology, 31(4), 840-852.

  • Guo, X., Yin, C., Yang, F., Zhang, Y., Huang, H., Wang, J., … & Xi, R. (2019). The cellular diversity and transcription factor code of Drosophila enteroendocrine cells. Cell reports, 29(12), 4172-4185.


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